Το 16ο Γυμνάσιο Αθήνας βρίσκεται στη συμβολή των οδών Πανόρμου και Λαρίσης 47 στους Αμπελόκηπους.
Συστεγάζεται από το 1980 με το 16ο Λύκειο Αθήνας.
Το κτίριο διαθέτει 2 ορόφους με αίθουσες διδασκαλίας και γραφεία διευθύνσεων και καθηγητών, κλειστή αίθουσα εκδηλώσεων και προαύλιο με μικρή υποδομή αθλητικών δραστηριοτήτων.
Υπάρχει εξοπλισμένο εργαστήριο πληροφορικής, μικρό εργαστήριο φυσικής-χημείας και μικρό εργαστήριο τεχνολογίας.
Διαθέτει εννέα (9) μεγάλες αίθουσες διδασκαλίας και τρεις (3) μικρότερες.